【法定雇用率（求職者のカウント）】障害者雇用の法定雇用率の対象となるどうかは、本人が「障害者手帳」を取得している必要があります。

うつ病など精神疾患によって休職している方はたくさんいますが、“精神疾患＝障害者手帳を取得していること”ではありません。
障害者手帳は、本人が行政の窓口に申請してはじめて交付されるものです。
障害者手帳を取得することは「障害者のレッテルを張られる」と思われる方もいますが、障害者手帳を取得することによって、多くの支援が受けられるというメリットもあります。
障害者手帳を取得するということは、ご自身で障害があるということを認め、受けとめることになりますが、そのことに抵抗がある人も少なくありません。
十分にご本人の意思を尊重し、企業側が「説得」したりするものではないことを理解する必要があります。

ご本人にとって本当にメリットがあるということでしたら、第三者を交えるなどして、慎重に話を進めるなど、無理のない形で進めていくことをおすすめします。